大专文凭档案是否还在学校，主要取决于毕业生是否已经落实就业单位以及是否与学校签订了相关协议。以下是几种可能的情况：

未落实就业单位：

如果大专毕业生在毕业时未落实就业单位，其档案可以免费保留在学校两年。在这两年期间，毕业生需要与高校就业指导中心签订档案、户口留校协议，以便学校暂时保管档案。

落实就业单位：

如果毕业生在毕业时已经落实了就业单位，并且该单位具有人事主管权，那么档案可以直接转入该单位进行保管。

超过两年未处理：

如果档案在学校保管超过两年仍未被转走，学校可能会将档案返还到生源地的人才中心。

其他特殊情况：

有些学校可能会将档案存放在学校内的档案管理部门，而不是直接报送当地的相关部门，具体情况需要参考当地的规定和实际情况。

综上所述，大专文凭档案是否还在学校，需要根据个人的具体情况来判断。如果未落实就业单位且未超过两年保管期限，档案一般还在学校。如果已经落实就业单位或超过两年保管期限，档案则可能被转往生源地人才中心或其他指定机构。建议毕业生在毕业后及时与学校就业指导中心联系，了解档案的具体处理情况，并按照相关规定办理档案的存放或转移手续。