南通市的民办大专院校包括：

南通理工学院：

办学层次为本科，主管部门为江苏省教育厅，所在地为南通市。南通理工学院的前身是紫琅职业技术学院，是一所全日制民办普通高等职业院校，2014年升格为南通理工学院。

南通大学杏林学院：

办学层次为本科，主管部门为江苏省教育厅，所在地为南通市。南通大学杏林学院也是一所本科学校，提供专科教育。

江苏工程职业技术学院：

办学层次为专科，但具体主管部门和所在地未在提供的信息中明确。

南通职业大学：

办学层次为专科，主管部门为江苏省教育厅，所在地为南通市。南通职业大学是一所公办院校。

南通科技职业学院：

办学层次为专科，主管部门为江苏省教育厅，所在地为南通市。南通科技职业学院的前身是国立高级农业职业学校，创建于1945年。

南通航运职业技术学院：

办学层次为专科，主管部门为江苏省教育厅，所在地为南通市。南通航运职业技术学院是一所公办院校。

江苏商贸职业学院：

办学层次为专科，主管部门为江苏省教育厅，所在地为南通市。江苏商贸职业学院是一所公办院校。

南通师范高等专科学校：

办学层次为专科，主管部门为江苏省教育厅，所在地为南通市。南通师范高等专科学校是一所公办院校。

紫琅职业技术学院：

位于港闸经济开发区永兴路，是一所民办高职院校。紫琅职业技术学院是南通理工学院的前身，2000年创建，2014年升格为南通理工学院。

南通海陵技工学校：

位于海安县，是一所集短训和全日制学制教育为一体的多层次、实用性强的技工学校。

请注意，以上信息是根据最近的数据更新的，具体学校的办学状态可能会有变化，建议联系学校或访问官方网站获取最新信息。