签订就业协议可能存在以下坏处：

限制自由流动：

签订就业协议后，毕业生在一定期限内不得随意解约，这可能会在一定程度上限制他们的自由流动，使他们难以在短时间内更换工作或探索其他职业机会。

潜在风险：

部分用人单位可能会利用就业协议中的不合理条款来损害毕业生的权益，例如设置不合理的违约金、服务期限等，这可能会对毕业生的未来职业发展造成不利影响。

心理压力：

面对即将到来的职业生涯，签订就业协议可能会给毕业生带来一定的心理压力，担心自己无法履行协议中的条款，或者对未来的职业发展产生不确定感。

影响应届生身份：

如果毕业生在大学期间和其他企业提前签订了三方协议，可能会失去应届生的身份，从而影响其参加公务员、事业单位等招聘考试的资格。

档案及工作关系变迁：

随意签订就业协议可能会影响毕业生的档案及工作关系变迁，例如档案可能会被留在没有档案保存资格的公司，导致后续工作调动困难。

法律责任：

就业协议是一种法律文件，如果签署后不严格履行协议内容，可能会导致违约金的产生，并可能引发法律纠纷。

综上所述，签订就业协议虽然有一定的好处，如稳定就业、明确职责和政策支持，但同时也存在不少潜在的坏处。因此，毕业生在签订就业协议时应认真考虑，确保协议内容合理且符合自身职业规划，避免因盲目签订而带来不必要的麻烦。