大专院校的科长 通常属于中层管理干部。具体级别可能因学校行政级别不同而有所差异。例如：

1. 在教育部直属高校，学生处副处长可能为正处级；

2. 在公办、省属、本科高校，学生处副处长可能为副处级；

3. 在公办、大专院校，学生处副处长可能为正科级。

此外，科长在公务员体系中通常属于中层干部，对应的级别是正科级，其级别大致在9至13级之间。

综合以上信息，可以得出结论：大专院校的科长在公务员体系中一般为正科级，在企事业单位中为中层管理干部，具体级别可能因学校行政级别不同而有所差异。