协议就业，通常指的是毕业生与用人单位之间签订的《就业协议书》，虽然具有一定的优势，但也存在一些潜在的坏处：

限制自由流动：

签订《就业协议书》后，毕业生在一定期限内不得随意解约，这可能会限制他们的自由流动，使他们难以在短时间内更换工作或探索其他职业机会。

潜在风险：

部分用人单位可能会利用《就业协议书》设置不合理的条款，损害毕业生的权益，例如不明确的工作内容、薪酬待遇或违约金等。

心理压力：

面对即将到来的职业生涯，签订《就业协议书》可能会给毕业生带来一定的心理压力，担心自己无法履行协议中的条款或面临违约的风险。

限制发展空间：

三方协议可能会规定一定的服务期限或违约金等条款，这会限制毕业生的自由选择权和发展空间，使他们可能错过更好的工作机会。

不公平待遇：

有些用人单位可能会利用《就业协议书》中的不公平条款来限制毕业生的工作自由和发展空间，例如限制工作时间、工作内容或职业发展。

薪酬待遇不透明：

有些毕业生就业协议中的薪酬待遇可能不够透明，可能会导致毕业生在工作中感到不公平或不满意。

社保和劳动保护缺失：

在三方协议失效，劳动合同还没有签订这段空窗期，毕业生可能面临社会保障权利的缺失，无法享受应有的医疗保障、工伤保障等劳动保护。

影响人际关系：

签订三方协议后，毕业生与用人单位之间的关系就变得较为紧密。如果毕业生在协议期内违约，可能会影响到与原单位的关系，甚至可能引发纠纷。

经济压力：

如果毕业生违约，可能需要支付违约金，这可能会给毕业生带来一定的经济压力。

法律风险：

随意签订就业协议可能会影响随后的档案及工作关系变迁，甚至可能涉及到法律责任。

综上所述，协议就业虽然可以提供稳定性和一定的政策优惠，但同时也存在诸多潜在的风险和限制。建议毕业生在签订《就业协议书》时，务必仔细阅读协议条款，了解自己的权益和义务，并在必要时寻求专业法律建议。